bioRxiv

义项:生命科学预印本平台
bioRxiv

bioRxiv是面向生命科学的非营利预印本平台,由美国冷泉港实验室(Cold Spring Harbor Laboratory,CSHL)于 2013 年 11 月推出,供研究人员免费发布尚未经同行评审的论文手稿,读者无须注册即可阅读[1][2]。它把研究成果的传播与期刊评审分开,使作者能在正式投稿前公开结果并获得反馈[3]。截至 2025 年 3 月,该平台累计收录约 26.8 万篇预印本,作者超过 97 万人[4]。

目录
  1. 定义
  2. 原理
  3. 发展历程
  4. 应用
  5. 局限
  6. 参见

定义

bioRxiv是一个在线存储与发布生命科学未发表论文手稿的预印本服务,由非营利研究教育机构冷泉港实验室建设和维护,作者投稿与读者阅读均不收费,阅读也不需要注册账号[5][2]。平台覆盖生物化学、生物信息学、生物物理、细胞生物学、发育生物学、生态学、进化生物学、遗传学、基因组学、免疫学、微生物学、神经科学、植物生物学、合成生物学、系统生物学与动物学等学科方向[6]。凡在生物医学领域尚未正式发表的原创研究稿件,均可在此公开,并附有数字对象标识符(DOI)与可下载的全文[2]。

预印本一词指尚未经过期刊同行评审即公开的学术文稿。bioRxiv不承担评审职能,仅作发布渠道,因此平台上的论文既不等同于已发表成果,也不代表通过了质量认证[3]。平台上线的稿件按性质分为新结果、证实性结果与矛盾性结果三类,分别对应领域内的推进、对既有工作的重复验证,以及与先前结论不一致的重复实验[5]。

原理

作者通过投稿系统上传完整论文的 PDF 文件,或提交文字稿与插图的组合,稿件随即进入筛选流程[3]。筛选分两级:先由平台工作人员进行内部初筛,包括借助相似度检测软件与搜索引擎查重,并排查垃圾内容、明显不当或残缺的稿件;再由分布在各处的具备科研经验的附属科学家(Affiliates)复审,确保每篇公开稿件都经过一名科研人员过目[3]。这份筛选只是粗筛,目的在于降低非科学内容出现的概率,并不对稿件结论作担保,读者仍需自行判断[3]。

技术层面,投稿端基于改造后的 BenchPress 系统,展示端建立在经修改的 Highwire JCore 技术上,冷泉港实验室的开发团队以脚本和外部数据库补充页面功能,站点还接入了第三方评论与标注工具[3]。每篇预印本只分配一个 DOI,可随时上传新版本,各版本均保留并有独立链接,DOI 默认指向最新版;自 2019 年起,作者批准日期被写入 DOI 后缀,便于从引用信息判断最初版本的发布时间[3]。为长期保存内容,全部稿件同时交存非营利归档机构 Portico[3]。

平台另设稿件直转机制,作者可将稿件文件与元数据从 bioRxiv 直接发送至合作期刊或评审服务,免去在期刊网站重复上传、重新填写作者信息的步骤[7]。站点也向机器读取开放,全部文章可自由获取,用于文本与数据挖掘[7]。

发展历程

2013 年 11 月,冷泉港实验室宣布上线 bioRxiv,定位为生物学家版的 arXiv,目标是加快研究传播,并让作者在正式同行评审之前获得反馈[8]。首年运行结束时,平台累计收到 800 余篇投稿,作者来自 44 个国家,覆盖 25 个学科,约 28% 的稿件经过修订[1]。

平台最初只接受基础生物学稿件,临床研究一律不收;2015 年至 2016 年间,这一限制以试点方式部分放开,允许流行病学与已注册临床试验两类临床研究上线,并另设临床附属专家参与筛选[3]。试点取得成效后,专门的临床研究预印本平台 medRxiv 于 2019 年成立,bioRxiv 相应停止接收这两个类别的新稿件[3][4]。

2019 年平台首投稿件超过 6.4 万篇,月投稿量由最初寥寥数篇增至 2900 篇以上,稿件修订比例长期稳定在 25% 至 30% 之间[9]。研究显示,预印本发布两年后约有 60% 的稿件在期刊发表,曾刊载其预印本的期刊达 700 种[2]。2020 年前后新冠疫情暴发期间,bioRxiv 与 medRxiv 快速传播了与新冠病毒相关的免疫学、病毒学和流行病学新发现[3]。

2025 年 3 月 11 日,平台联合创始人宣布 bioRxiv 和 medRxiv 将转由新成立的非营利组织 openRxiv 运营,此前两家平台一直由冷泉港实验室管理;openRxiv 获得陈·扎克伯格倡议 1600 万美元资助,并设立董事会与科学医学顾问委员会[4]。至此时点,bioRxiv 累计收录约 26.8 万篇预印本,作者超过 97 万人,月访问量超 1100 万人次,每月新增投稿约 4000 篇[4]。

应用

科研人员利用该平台在论文送审前公开结果,从而尽早确立研究发现的时间先后,并就方法或结论收集同行意见[3]。对处于职业早期的研究者,预印本可作为科研产出的公开凭据,供基金评审和招聘委员会参考;难以在期刊发表的结果,例如矛盾的或仅属重复验证的数据,也可借此公开[2]。

预印本发布还带动了围绕评审方式的多种尝试。EMBO 与 ASAPbio 合作的 Review Commons 为作者提供独立于期刊的同行评审,评审报告与作者答复随稿件公开,作者再携带这些材料投往合作期刊[10]。一些期刊则直接在预印本基础上组织评审,如生物学领域的部分刊物要求投稿先以预印本形式发布[10]。2021 年平台推出展示面板,汇集针对各篇预印本的科学讨论与评价链接[10]。

在科研评价端,部分国家和机构已将预印本纳入考量。至 2025 年,美国约 25% 的高校把预印本论文视为有效研究成果并计入职称晋升评审;2024 年对 7100 余名 bioRxiv 与 medRxiv 作者的调查中,77% 的受访者认为平台提升了其成果的知名度[4]。

局限

平台不进行同行评审,这是其基本设计。筛选仅是快速、粗略的过滤,用于减少非真正生物学研究的内容出现,既不保证也不认证稿件的科学有效性[3]。因此,预印本上的结论可能随后被修正甚至推翻,引用时须区分其与经评审论文的证据强度。

发表与评审分离也带来使用上的边界。作者调查显示,约 30% 的人在投稿期刊前数周至数月发布预印本,55% 在临近投稿时发布,说明多数预印本与期刊投稿时间接近,尚未形成完全独立的传播渠道[3]。尽管预印本接受度提高,期刊指标与声誉仍在科研人员晋升中起主要作用,预印本与期刊论文目前处于互补而非替代关系[10]。

学科范围也有限制。平台起初明确排除临床研究,不接受临床试验等医学相关稿件,2019 年后此类内容转由 medRxiv 承接[3]。物理、数学或社会科学稿件只有在与生命科学直接相关时才被接收[5]。此外,平台不接收食谱、教材摘录、叙述性综述和思辨性理论等非研究类文章,以集中筛选资源[3]。

站内评论活跃度有限。上线首年后,平台虽为每篇论文开设评论功能,但评论数量并不算多,反馈更多通过社交媒体和作者私人邮件渠道产生[1]。

参见

  • 预印本 —— bioRxiv 所发布内容的基本形态,指未经期刊同行评审即公开的学术文稿。

  • medRxiv —— 2019 年上线的医学领域预印本平台,与 bioRxiv 同源运营。

  • arXiv —— 物理学等领域的早期预印本平台,bioRxiv 在概念上以其为参照。

  • 同行评审 —— 期刊对论文的质量评估机制,bioRxiv 明确不承担这一环节。

  • 数字对象标识符 —— 平台为每篇预印本分配的持久标识,用于引用与版本追踪。

  • 开放科学 —— 预印本共享所归属的科研实践潮流。

参考资料

  1. BioRxiv at 1 year: A promising start - Skip to main content [引用日期2026-10-29]
  2. The bioRxiv Preprint Server: [引用日期2026-10-29]
  3. bioRxiv: the preprint server for biology [引用日期2026-10-29]
  4. 预印本平台bioRxiv和medRxiv开启独立运营时代 [引用日期2026-10-29]
  5. 【外文资源】BioRxiv 预印本平台 [引用日期2026-10-29]
  6. bioRxiv : the preprint server for biology [引用日期2026-10-29]
  7. About bioRxiv [引用日期2026-10-29]
  8. [LIS-Forum] "BioRxiv": biologists' version of arXiv [引用日期2026-10-29]
  9. 833400v1 [引用日期2026-10-29]
  10. Staying-ahead-of-the-curve-a-decade-of-preprints [引用日期2026-10-29]
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最近更新:2026-10-28T18:27:00Z

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